Иван Алексеевич любил посещать Александро-Невскую Лавру, где сам строго следил за правильностью богослужения, давал указания священнослужителям, научал молодых священников, служил часто и за чтеца и псаломщика. Когда ему предложили принять постриг и стать епископом, он ответил:
     "Мои ученики давно уже митрополиты, мог быть и я, но я не имею дара
      красноречия, я только узко-кабинетный ученый и люблю свою работу".

Арестовывался ОГПУ в 1929г., сидел в тюрьме около двух месяцев, после чего был освобожден. По данным [1],[6],[7] арестовывался в 1930г. по делу "евлогиевцев". При одном из арестов у Ивана Алексеевича пропала уникальная библиотека и научный архив.