Места заключения
Северные лагеря 
Казахская ССР, г.Алма-Ата 
В 1930-м или 31-м году о.Иоанна привели этапом в ссылку в Алма-Ату после пребывания
в лагерях.
Из воспоминаний Анастасии Нагибиной (родом из с.Колпаковка, где раньше служил о.Иоанн),
трудившейся и жившей с монахинями в начале 1930-х гг. при Свято-Николаевском храме
г.Алма-Аты [2]:
    "Помню, зашел он в комнату, весь в пыли, одежда грязная, в латках.
     Это был скелет, обтянутый кожей, с выпуклым черепом на тонкой шее.
     Но я сразу узнала его, и мать Феодора узнала и — табурет ему:
     "Садитесь, батюшка." — "Нет, не сяду. Дайте мне гребешок". Дали ему гребешок,
     он вышел на улицу, и я за ним выскочила — что он будет делать с гребешком?
     Он пошел в среднюю аллею двора, остановился, стал расчесывать волосы и
     сбрасывать с гребешка на землю вшей. Так он и волосы вычесал, и брови.
     Потом в церковь зашел и сказал: "Ну вот, теперь можно и посидеть... ".
     Мы позвали старосту, Шахворостова Георгия Васильевича. Он
     пошел по прихожанам, собрал ему одежду, повел его в санпропускник и вымыл.
     Все тело батюшки было до костей изъедено насекомыми (вшами).
     Отца Иоанна мы устроили на работу сторожем при какой-то организации.
     Дали ему чулан, в котором он мог жить.
     О.Иоанн был крайне истощенным, ночью дежурил, все остальное время лежал
     в чулане... "