Промыслом Божиим о.Митрофан был назначен церковной властью священником в Черниговский драгунский полк, шефом которого была Великая Княгиня Елизавета Федоровна, В Орле он всего себя отдал служению Богу и духовной помощи пастве. Он был утешителем многих, прекрасным и серьезным проповедником, крепким и ревностным пастырем. Создался крепкий приход, и это позволило о.Митрофану приняться за трудное дело постройки храма, которое он с успехом закончил. Он создал при приходе библиотеку и школу. Все получаемые от благотворителей средства отец Митрофан жертвовал на храм, школу и библиотеку. Из воспоминаний об о.Митрофане матушки Надежды (Бреннер) [7]:
     "Он еще молодым священником удостоился явления Царицы Небесной. Она благословила
      его строить храм во имя Покрова, и он, без всяких средств, с великой
      помощью Божией построил. Не хватало кирпича, и Матерь Божия пришла во сне
      к местной заводчице кирпичной что же, — говорит, — ты каждый день ездишь
      мимо дорогого для Меня строительства, а не видишь, что там кирпича не
      хватает!" Она говорит: "Кто Вы?" — "Я Хозяйка дома, который строят". Та
      скорей в церковь: "Как же это я каждый день тут езжу и не вижу вашу нужду?"
      — и до конца снабжала строительство бесплатным кирпичом.
      Батюшка при церкви школу открыл, библиотеку собрал и преподавал сам детям".
Летом 1903г. в Сарове состоялось торжественное прославление прп.Серафима. На этих торжествах был о.Митрофан. Здесь он был представлен Великой Княгине Елизавете Федоровне и произвел на нее самое благоприятное впечатление — своей искренней верой, простотой, смирением и отсутствием какого-либо лукавства