Перед праздником Сретения, 13 февраля 1938г., перед домом о.Владимира остановилась машина, откуда вышло трое сотрудников НКВД. Они предъявили ордер на обыск и арест. В тюрьме врач обследовал состояние здоровья семидесятидвухлетнего священника и выписал справку: склероз сердца, старческая дряхлость; годен к физическому труду третьей категории. Один из свидетелей священник-обновленец показал, что о.Владимир — священник "тихоновского порядка", говорил: "Новообрядцы — это предатели Православной Церкви, они ее предали антихристам-коммунистам". Исходя из показаний свидетелей — штатных осведомителей НКВД, о.Владимиру было предъявлено обвинение в контрреволюционной деятельности, в чем о.Владимир виновным себя не признал.