26 декабря 1921/08 января 1922г. хиротонисан во епископа Стародубского и Мглинского, викария Черниговской епархии

Проживал в г.Стародубе (центр уезда Гомельской губ. РСФСР (1919–1926), Брянской обл. (с 1944г.)). Окормлял приходы Стародубского и Мглинского уездов Гомельской губ. В декабре 1922г., пытаясь сохранить кафедру под каноническим управлением, проводил политику компромиссов с обновленцами. Подписал "Устав прогрессивной группы духовенства и мирян Черниговской епархии", стоящей на платформе "Живой Церкви". При этом препятствовал деятельности уполномоченного ВЦУ по Гомельской епархии прот.Симеона Канарского (впоследствии обновленческий "архиерей"), отказывался совершать хиротонии живоцерковников во священники и диаконы. Это привело к жалобам Канарского в ВЦУ "о положении бездействия в епархии" и к просьбам об удалении епископа Памфила из Стародуба. Указом обновленческого ВЦУ от 17 января 1923г. епископ Памфил был назначен епископом Уфимским и Мензелинским, председателем обновленческого Уфимского Епархиального управления, но назначения не принял. 2 марта 1923г. обновленцы издали указ о признании епископа Памфила "вредным для дела обновления в пределах епархии" и определило его на жительство в Пермскую епархию "без права служения". Но епископ Памфил отказался оставить паству и в Пермь не выехал

5 апреля арестован, помещен в холодный и сырой Стародубский арестный дом

24 августа 1923г. постановлением Комиссии НКВД по административным высылкам приговорен к двум годам ссылки в г.Яренск Архангельской губ. [Зв4 (ГА РФ. Ф.8409. Оп.1. Д.148. Л.86.)]

Находился сначала в Стародубском арестном доме, затем отправлен в Москву

С 1 июля 1923г. — в заключении в Москве. В сентябре 1923г. написал заявление в Комитет помощи политзаключенным с просьбой передать квитанцию от 1 июня 1923г. и доверенность Е.М.Зверевой для получения отобранных у него в ГПУ книг [Зв4 (ГА РФ. Ф.Р-8409. Оп.1. Д.28. Л.175.)]. Принес покаяние Патриарху Тихону

К 1924г. уже находился в ссылке в Северо-Двинской губ. (Архангельская о.). Срок наказания, который кончался в апреле — августе 1925г., отбыл