Полтавская духовная семинария последние годы своего существования переживала серьезные проблемы в воспитании семинаристов. В 1905г. семинарию неоднократно закрывали за революционные бунты и беспорядки. Такой досталась семинария в управление архимандриту Памфилу. К тому же на пороге была Первая мировая война и революция. С началом войны в семинарии размещалось эвакуированное Виленское военное училище, а также она служила лазаретом для раненых воинов. О.Памфил старался словом и примером прививать семинаристам патриотизм, любовь к Богу и Родине. В 1915г. с наступлением австрийской армии целый ряд уездов Волынской губернии был оккупирован. У архимандрита Памфила на Волыни оставались родственники: братья, сестры, отец. В числе беженцев, эвакуированных из оккупированной части Дубенского уезда, оказался родной брат владыки Евгений Лясковский. О.Памфил написал письмо наблюдателю церковно-приходских школ протоиерею Феодору Казанскому с просьбой устроить брата на преподавательскую должность. Эта просьба вскоре была удовлетворена. Среди беженцев оказалась и родная сестра владыки Памфила — Мария Лясковская, которая была учительницей в церковно- приходской школе г.Луцка. В январе 1918г. в Полтаве утвердилась власть большевиков, и вскоре семинарию закрыли. Архимандрит Памфил оказался последним ректором Полтавской Духовной Семинарии. В 1918г. архимандрит Памфил был уволен от духовно-учебной службы