31 мая/13 июня 1928г. был назначен епископом Астраханским и Енотаевским. Все в Астрахани увидели в архиепископе Филиппе достойного преемника прежнего Владыки, архиепископа Фаддея (Успенского), перемещенного на Тверскую кафедру. Он сразу расположил к себе духовенство и паству. Свою деятельность в Астрахани Владыка Филипп начал с того, что принялся обучать молившихся общенародному пению. Он резко высказался против, как называл это он сам, "безобразного театрального пения". В своих посланиях Приходским советам он дал подробные указания, как правильно, с духовной и уставной точки зрения, устраивать чтение и пение за богослужением. Астрахань в то время была охвачена обновленческой смутой. При поддержке властей обновленцы захватили 15 из 25 действующих церквей. Верующие были обуреваемы тревогой и недоумением. С приездом архиепископа Филиппа приходская жизнь в "староцерковнических" храмах стала налаживаться, проходить по истинно православному чину. За каждым богослужением Владыка Филипп произносил обстоятельную проповедь и поучение нравственного содержания. Еженедельно после акафистов и великих вечерен, сопровождавшихся общим пением, вел беседы с верующими. И это возымело действие: церковный народ успокоился, ушло смятение и тревога, охватившие людей во время наступления обновленческого раскола. Владыка был замечательным проповедником. Речь его была образной и убедительной, уста его глаголали "от избытка сердца". Благодаря своей неутомимой энергии и вниманию к народу и духовенству, он уже в первый год своего пребывания в Астрахани приобрел огромный авторитет и был окружен всеобщей любовью