Боролся с обновленчеством. В воскресенье 12 марта 1922г. в Смоленске, в усыпальнице Смоленского Успенского кафедрального собора состоялось собрание прихожан. С докладом выступил инженер-путеец Залесский, заявивший, что изъятие священных сосудов и риз — против законов Церкви и оскорбительно для верующих. Эти предметы могут быть заменены их денежным или продуктовым эквивалентом. Под этой резолюцией было собрано 5 тысяч подписей. Для дальнейших переговоров с представителями власти верующие избрали комиссию из 25 человек, в которой были представлены все приходы Смоленска. Настоятель Успенского кафедрального собора присутствовал на этом собрании. В понедельник 13 марта в Успенский собор прибыла Комиссия по изъятию церковных ценностей. Группа разгневанных прихожан из 300 человек не допустила комиссию к работе. 14 марта комиссия вторично пыталась приступить к "изъятию", но группа прихожан (около 500 человек) снова не допустила ее к работе. В Смоленск с красноармейцами прибыл Л.Д.Троцкий для личного руководства процессом. К вечеру 14 марта группа верующих в количестве 6–7 тысяч человек окружила собор... В Губкомиссию был вызван епископ Филипп... 28 марта в 5 часов утра был выставлен караул около Успенского собора, Троицкого и Вознесенского монастырей, а в 10 часов комиссия должна была приступить к "изъятию". Около 10 часов утра к собору начали собираться люди, вскоре число их достигло нескольких тысяч. В некоторых церквях ударили в набат, и это еще больше увеличило число защитников собора. Люди теснили красноармейцев все сильнее. Командир 1-го полка особого назначения дал приказ стрелять вверх, сначала из винтовок, потом — из пулемета. Во время этих событий одна женщина была убита, несколько человек было ранено, в том числе двое тяжело. Толпа была быстро рассеяна. Комиссия подошла к собору, но он был заперт и забаррикадирован изнутри. Двери взломали — внутри оказались верующие мужчины, женщины и дети — всего 21 человек. Ценности Успенского собора были очень быстро изъяты. Из отчета комиссии по "изъятию":
    "Подготовленными и экстренными мерами сопротивление было сломлено, и изъятие
     во всех остальных местах прошло безболезненно. По делу событий ведется
     следствие. Виновники будут преданы Суду Революционного Трибунала".
В течение нескольких дней город Смоленск находился на грани восстания. В ночь на 29 марта 1922г. начались аресты "церковников" по этому делу

Был арестован ЧК за "хранение контрреволюционной литературы" и посажен в тюрьму. По другим данным арестован 12 мая 1922г.

Из сообщений в советской прессе 1922г. о суде в связи с епископом Филиппом:
   "В черном клобуке, с широчайшей темно-русой бородой. Ему 48 лет, а на вид
    гораздо меньше. Высокий, стройный, грудь впалая, а под монашеской рукой
    чувствуется железная сила. Облик аскета и фанатика...
    Епископ Филипп (Виталий Ставицкий) обвиняется в том, что распространял
    заведомо контрреволюционные воззвания Патриарха Тихона, а также сам составил
    размножил и распространял воззвание к верующим, в коем призывал верующих
    церковных ценностей не отдавать, последствием чего было нападение толпы
    на красноармейскую охрану, повлекшее за собой человеческие жертвы"

По делу о "хранении к/р литературы" был оправдан в июне 1922г., но из тюрьмы не был выпущен. Против него и других "главных организаторов мятежа в Смоленском Успенском соборе" было возбуждено новое дело в связи с "сопротивлением изъятию церковных ценностей"