В 1949г. к Астраханской и Сталинградской епархиям Владыке присоединили еще Саратовскую епархию

На Владыку возлагался надзор над одним из немногих в то время учебных заведений Русской Православной Церкви — Саратовской Духовной Семинарией. К тому времени традиция богословского образования в России была прервана. Богословские образовательные учреждения почти все были закрыты. Лекторы, администраторы и профессура подверглись гонениям, и пополнение епархий и приходов подготовленными кадрами почти совсем прекратилось. Владыка Филипп, один из немногих переживших гонения архипастырей, хорошо знавших и глубоко почитавших традиции и опыт прежней, дореволюционной русской Духовной школы, внес огромный вклад в возобновление системы православного богословского и пастырского образования Русской Церкви. На поприще организации богословского и литургического преподавания, воспитания будущего духовенства, обустройства семинарского обучения и быта, он проявил себя не только хорошим организатором и любящим отцом, но и видным педагогом, знатоком богословских и церковных наук. Плоды его деятельности в этой области особенно заметны были в Саратове и и окрестных епархиях, где более, чем через полвека, бывшие семинаристы, воспитанники послевоенных лет с благодарностью вспоминали своего духовного отца и учителя. Владыка спешил послужить Богу на всяком месте, где он оказывался. Уже пожилой человек, здоровье и физические силы которого надломились в тюрьмах и ссылках, он продолжал вести кипучую деятельность, оставаясь на удивление веселым и жизнерадостным, распространяя внутренний свет и вселяя уверенность во всех, окружавших его. Его тщанием и заботой были отстроены, отремонтированы и украшены десятки храмов, были возведены и расписаны десятки иконостасов, отреставрирована стенная живопись, заведена новая утварь, отлиты и подняты колокола. И, самое главное, в этих храмах была возобновлена литургическая жизнь. Владыку могли видеть за собственноручным изготовлением эскизов, за работой среди архитекторов, мастеров, с бригадами живописцев, на строительных лесах, под самыми куполами, на колокольнях, на открытом им свечном заводе. С одними он советовался, других наставлял и учил