В марте 1906г. игумения Ювеналия была перемещена в Званский Знаменский монастырь Новгородской епархии и в августе 1906г. возвращена на прежнее место служения

27 марта 1907г. игумения Ювеналия была назначена заведующей монастырской второклассной школы. школы. Она имела планы устроить в приморском селении под Батуми подворье с церковью, школой и санаторием, но эти планы не успели осуществиться. В 1905–1907гг. горцы часто совершали нападения на крестьян, живших в окрестностях Бодбийского монастыря, и игумения Ювеналия брала обижаемых под свою защиту. 27 ноября 1907г. "революционно" настроенные горцы обстреляли экипаж, в котором матушка вместе со своими спутницами выехала из Тифлиса в обитель. Все они были спасены от смерти заступничеством преподобного Серафима Саровского, чудотворный образ которого матушка держала у себя на груди и к которому во время обстрела громко взывала: "Преподобне отче Серафиме, спаси нас!". Чтобы оградить жизнь игумении от опасности, многие иерархи стали ходатайствовать о переводе ее в Москву, среди них был духовный отец матушки Преосвященный Гермоген (Долганев). Покидая родную Грузию, чтобы послужить Богу и ближним в далекой России, матушка благодарила его за отеческую заботу и просила архипастырского благословения в путь