Выйдя на свободу, о.Михаил стал настоятелем церкви Михаила Архангела в Малой Коломне, в центре Ленинграда. Он продолжал преподавание на Высших Богословских курсах (профессор по курсам "Догматическое богословие" и "Новый Завет"). Это было тогда единственное в стране учебное заведение, готовившее священнослужителей. Летом 1928г., в разгар иосифлянского раскола в церкви, о.Михаил, находясь на даче, написал сочинение "В чем причина церковной разрухи" (впервые опубликованное в альманахе "Минувшее", 1994г.). В этом сочинении была сделана попытка — с учетом собственного опыта и многолетних наблюдений — разобраться по свежим следам в создавшемся чрезвычайно драматическом положении, когда недавние союзники по борьбе с обновленцами оказались разделенными в вопросе взаимоотношений Церкви и государства. Хотя о.Михаил, бывший настоятелем храма, не присоединился к "иосифлянам", нижняя часть церкви была занята иосифлянами. По данным [Д3] о.Михаил служил также в Воскресенской Мало-Коломенской церкви г.Ленинграда