По сфабрикованному большевиками "делу о сопротивлении изъятию церковных ценностей" на скамье подсудимых оказались митрополит Петроградский Вениамин и самые близкие к нему православные священники и миряне — всего 86 человек, в том числе — протоиерей Михаил Чельцов. Истинной причиной ареста и осуждения о.Михаила была его деятельность на посту председателя Епархиального Совета и близость к митрополиту Вениамину. О.Михаил не был членом Правления Петроградских Православных приходов, хотя в приговоре и числится таковым. О.Михаил был приговорен к расстрелу постановлением Петроградского Губревтрибунала Постановлением Президиума ВЦИК от 3 августа 1922г. расстрел был заменен 5-ью годами тюремного заключения. Впоследствии срок был сокращен до полутора лет