Стойкость и последовательность в отношении к обновленчеству стали одной из причин ареста епископа Венедикта в ходе следствия по делу "нелегального Совета епископов" 16 декабря 1925г. Епископ Венедикт был заключен в тюрьму г.Ленинграда. По другим данным [15], дата ареста — 18 декабря 1925г.