Был арестован по запросу СПО ОГПУ, в которое поступили сведения "о том, что б.пом. обер-секретаря царского сената — Аксенов Л.Д. установил нелегальную связь с бело-эмигрантскими церковниками, которых снабжает клеветнической информацией о положении в СССР...", на основании этого было дано указание: "Произведите тщательный обыск у известного церковника АКСЕНОВА Леонида Дмитриевича, с целью обнаружения материалов о его связях с церковниками, проживающими в СССР и за рубежом. Независимо от результатов обыска арестуйте и направьте спецконвоем в наше распоряжение" и "У Аксенова Л.Д. проведите тщательный обыск, подвергнете изъятию всю переписку, рукописи и фотоснимки — обратив внимание на документы, указывающие на связь с ссылкой, концлагерем и заграницей". В записке, приложенной к делу упоминались о следственных делах 1920г.,1924г.,1925г.