На допросах епископ Иаков отказался давать показания против арестованных вместе с ним людей (благодаря чему многие из обвиняемых были освобождены). Он отклонил обвинения политического характера и не признал себя виновным в "антисоветской деятельности". 9 июня 1930г. он был приговорен Особым Совещанием при Коллегии ОГПУ к 3 годам концлагерей. Вместе с ним были приговорены еще четырнадцать человек: четверо — к трем годам концлагеря, шестеро — к трем годам ссылки, один — к тюремному заключению на четыре месяца, трое освобождены с ограничением выбора места жительства, с поступлением на три года под надзор властей