В октябре 1923г. епископ Иаков выехал в Москву, где встретился с Патриархом Тихоном и получил от него ставленническую грамоту на Орскую кафедру, а также назначение временно управляющим Оренбургской православной епархией. Тогда же он провел тайные переговоры с раскольниками и дал подписку о подчинении обновленческому Синоду (т.наз. тайное, или скрытое обновленчество). 21 октября 1923г. с разрешения гражданской власти сформировал и возглавил временное Епархиальное управление, которое издало декларацию об осуждении "контрреволюционной деятельности Патриарха Тихона и о "линии проведения обновленческого движения, хотя на первый раз и не в широких формах".
Епископ Иаков проводил двойственную "полуобновленческую" политику, признавая Патриарха Тихона каноническим главой Церкви, а обновленческий Синод — административным органом управления. 26 ноября 1923г. указом обновленческого Синода епископ Иаков был назначен епископом Оренбургским и Тургайским, председателем Оренбургского епархиального управления. Сведения об этом указе держались в строгой тайне от епархии. Фактически епископ Иаков одновременно входил в состав и православной иерархии (как викарный епископ Орский, в/у Оренбургской епархии, а ), и обновленческой иерархии (как правящий Оренбургский архиерей). 2 декабря 1923г. на общем собрании представителей приходов Оренбурга епископ Иаков озвучил основные положения своей новой церковной платформы, в соответствии с которыми собрание заявило о полной лояльности Советской власти. Собрание подтвердило верность соборному началу Церкви, но выступило против патриаршества, согласилось с негативной оценкой деятельности Патриарха Тихона как "вовлечения Церкви в политическую борьбу", одобрило отказ от административного подчинения Святейшему Патриарху, при сохранении канонического послушания ему как законному главе Русской Церкви и признало "правительственным церковным органом" обновленческий Синод. 4–5 декабря 1923г. состоялся Оренбургский Епархиальный съезд, который всецело одобрил "полуобновленческую" платформу епископа Иакова и избрал его Оренбургским архиереем. Результатом церковной политики епископа Иакова стала легализация Оренбургского Епархиального управления, зарегистрированного Губисполкомом в декабре 1923г. 23 мая 1923г., в связи с новым законодательством о регистрации религиозных организаций, Губисполком зарегистрировал Устав Оренбургско-Тургайского Епархиального Объединения, в состав которого вошло более 300 приходов, находившихся под управлением епископа Иакова, т.е. практически все приходы епархии — как православные, так и обновленческие