Отбывал заключение вместе с епископом Варнавой (Беляевым). В лагере был определен на земляные работы, но затем назначен кладовщиком. За честность и неподкупность на этой должности был оклеветан и отправлен в штрафную командировку. Монахиня Екатерина (Чичерина), находившаяся в том же лагере, вспоминала об о.Киприане: "Всегда ровный, светлый, ясный. Сначала определили ему земляные работы, а потом назначили кладовщиком. И тут начались беды. За честность и неподкупность, нежелательную для окружающих, его оклеветали и отправили в штрафную командировку к самым отъявленным разбойникам и жуликам [ущелье Коркучи]... Более мрачное место трудно представить... Здесь о.Киприану многое пришлось претерпеть — его окружали грубость, распущенность и развращенность. Но он все побеждал своей кротостью. Будучи дневальным в палатке этих разнузданных людей, он им не перечил, не укорял, старался услужить, любил их, и когда вскоре умер в больнице, то один из них вспоминал о нем со слезами"