22 ноября 1920г. комиссия при Челябинской ГубЧК по применению амнистии в честь годовщины Октябрьской Революции заслушала дело "по обвинению Малышева Н.А. в агитации против Советской власти, по которому он был осужден на 1 год принудительных работ", и постановила:
      "Амнистировать полностью". Но освобожден о.Николай из Челябинского концлагеря тогда не был

ГУ ОГАЧО Ф.Р-467. Оп.4. Д.540. Срок заключения о.Николая должен был окончиться в 20-х числах февраля 1921г. В связи с этим 21 февраля 1921г. помуполномоченный ЧК Анисимов составил заключительный акт:
  "Усматривая в действиях Малышева антисоветскую агитацию в 1918–1919гг.
   как давность, ПОЛАГАЮ:
   применив полную Октябрьскую амнистию, приговорить его к 5 годам заключения
   в Доме лишения свободы. Считать приговор условным".
11 марта 1921г. Постановлением Челябинской ГубЧК по борьбе с контрреволюцией и саботажем, за контрреволюционную деятельность, был приговорен к 5 годам заключения в Доме лишения свободы, в силу амнистии приговор считать условным